Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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