Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl49Q9CQ40 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mrpl49Q9CQ40 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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