Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Commd4Q9CQ02 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms