Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW4

Arpc5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5Q9CPW4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5Q9CPW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5Q9CPW4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms