Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLVAPQ9BX97 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLVAPQ9BX97 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms