Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn6Q99PL6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn6Q99PL6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn6Q99PL6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn6Q99PL6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn6Q99PL6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn6Q99PL6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn6Q99PL6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn6Q99PL6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms