Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ms4a6cQ99N08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ms4a6cQ99N08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a6cQ99N08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ms4a6cQ99N08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ms4a6cQ99N08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ms4a6cQ99N08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a6cQ99N08 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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