Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q99LU8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q99LU8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q99LU8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q99LU8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q99LU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99LU8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99LU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99LU8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99LU8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q99LU8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q99LU8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q99LU8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q99LU8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms