Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms