Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMD11Q96NU1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms