Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Cldn16Q925N4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn16Q925N4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn16Q925N4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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