Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip5Q8R361 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms