Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSIP1Q8NA03 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSIP1Q8NA03 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms