Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spire2Q8K1S6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms