Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34c1Q8K193 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn34c1Q8K193 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn34c1Q8K193 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn34c1Q8K193 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cldn34c1Q8K193 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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