Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc34Q8CFI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc34Q8CFI2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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