Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9030612E09RikQ8CE20 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9030612E09RikQ8CE20 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms