Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chd9Q8BYH8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd9Q8BYH8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms