Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6kb1Q8BSK8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms