Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms