Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms