Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Limd2Q8BGB5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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