Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms