Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tnfsf18Q7TS55 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tnfsf18Q7TS55 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tnfsf18Q7TS55 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tnfsf18Q7TS55 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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