Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms