Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AY358078Q6UY53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AY358078Q6UY53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms