Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms