Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms