Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scaf4Q6PFF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms