Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Msl1Q6PDM1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msl1Q6PDM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msl1Q6PDM1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msl1Q6PDM1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms