Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Papd7Q6PB75 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Papd7Q6PB75 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms