Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXY1

Tbc1d31, TBC1 domain family member 31, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d31Q6NXY1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d31Q6NXY1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d31Q6NXY1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms