Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt77Q6IFZ6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms