Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.3 ms