Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nlrp4eQ66X19 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms