Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc18Q640L5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ccdc18Q640L5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc18Q640L5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms