Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tff3Q62395 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms