Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinQ61043 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinQ61043 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinQ61043 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinQ61043 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinQ61043 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NinQ61043 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinQ61043 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinQ61043 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinQ61043 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinQ61043 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinQ61043 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinQ61043 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinQ61043 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinQ61043 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinQ61043 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinQ61043 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinQ61043 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinQ61043 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinQ61043 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinQ61043 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NinQ61043 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinQ61043 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NinQ61043 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NinQ61043 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NinQ61043 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NinQ61043 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NinQ61043 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NinQ61043 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms