Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp4Q60972 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp4Q60972 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms