Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Neurod1Q60867 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Neurod1Q60867 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms