Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf4Q60793 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms