Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf3Q60765 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms