Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sema5bQ60519 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms