Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms