Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms