Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q504N7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q504N7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q504N7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q504N7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q504N7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q504N7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q504N7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms