Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700057G04RikQ3V0U0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700057G04RikQ3V0U0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms