Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms