Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc160Q3UYG1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc160Q3UYG1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms