Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BtrcQ3ULA2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BtrcQ3ULA2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms